Если Вы (ФЛП, юр лицо) осуществляете выплату дохода физическому лицу (НЕ предпринимателю) - Вы выступаете налоговым агентом.

Налоговый агент обязан подавать в свою РНИ декларацию по подоходному налогу.

Например, Вы начислили физ лицу в марте 100 руб. Тогда удерживаете необходимый процент (например, 20%) - 20 руб. Выплачиваете ему 80 руб. Эти 20 руб. (подоходный налог) платите в бюджет в день выплаты дохода физ лицу. Платите на счёт "Подоходный налог по договорам и контрактам", т. е. это НЕ тот счёт, на который платится подоходный с ЗП.

И сдаёте отчёт по подоходному налогу, где начисленная сумма - 100 руб, удержанная сумма - 20 руб.

Похожая статья: Если перевозчик - Ваш друг. Какие документы нужны и что нужно уплатить в бюджет